教育部公文中出現「依據中華民國憲法，目前我國首都應為南京」文字引發爭議，承辦官員晚間坦承陳述不完整，表達歉意並願意負起行政責任。

教育部要求中小學地理、歷史科使用地圖、地球儀教具時，上頭對台灣與中國大陸的顏色標示、首都圖例符號等，希望能與教科書一致，本月2日發文國立暨私立高中高職、各國立學校附設國民中小學等單位，說明相關規定。

然而，公文內文中寫到「另於首都之標示，依據中華民國憲法，目前我國首都應為南京。」有教授將公文貼在網路上，引起網友熱議。

教育部國民及學前教育署國中小及學前教育組長邱乾國表示，中華民國訓政時期的「訓政約法」，有提到首都是南京，但立憲後憲法卻沒有明確提到。

民國86年教育部曾訂出地理教科書編審原則，遇到類似狀況時，將首都標示符號標在台北，並以文字說明是「中央政府所在地」。

邱乾國表示，「中央政府所在地」的寫法是比較合適的作法，公文中也有明確說明。但提到「南京」的部分過於簡略，沒有作完整陳述，他感到抱歉和遺憾，並願意負起行政責任。

邱乾國強調，現在教科書中的地圖如果有需要，都是在台北標示首都符號，並另以文字說明是「中央政府所在地」。